Nosso congresso será realizado de 16 a 19 de setembro de 2024 no centro de difusão internacional da USP em São Paulo, e contará com a inserção de sessões destacando também os avanços em Metabolômica.
Anais do 6º congresso da Sociedade Brasileira de Proteômica - Summit Brasileiro de Metabolômica
Áreas
Home
Áreas
Resumos para a área: METODOLOGIAS INOVADORAS E FERRAMENTAS COMPUTACIONAIS NAS CIÊNCIAS ÔMICAS
Advances in Metabolite Identification Using Ion Mobility and Ion Vibrational Spectroscopy
Thiago Carita Correra (Departamento de Química Fundamental - Instituto de Química da USP); César Augusto Gonçalves Dantas (Departamento de Química Fundamental - Instituto de Química da USP); Pedro Henrique Martins Garcia (Departamento de Química Fundamental - Instituto de Química da USP);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: drug metabolites, trasnformation products, ion spectroscopy, ion mobility,
Cochlear Proteomics: Insights into the Auditory Pathophysiology
Ana Carla Batissoco (FMUSP - Departamento de Otorrinolaringologia da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo); Ana Carolina Ferreira Scatone (FMUSP - Departamento de Otorrinolaringologia da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo); Lia Finzi Marques (FMUSP - Departamento de Otorrinolaringologia da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo); Danillo Alencar Coutinho (FMUSP - Departamento de Otorrinolaringologia da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo); Stella Diogo Cavassana (FMUSP - Departamento de Otorrinolaringologia da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo); Jeanne Oiticica (FMUSP - Departamento de Otorrinolaringologia da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo); Karina Lezirovitz (FMUSP - Departamento de Otorrinolaringologia da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo); Ricardo Ferreira Bento (FMUSP - Departamento de Otorrinolaringologia da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: cochlea, hearing loss, regeneration of inner ear, proteomic,
ALGORITHM FOR PROTEIN SEQUENCING FROM MASS SPECTROMETRY DATA
Celso Vítor Alves Queiroz Calomeno (ICC, FIOCRUZ - CARLOS CHAGAS INSTITUTE, FIOCRUZ); Michel Batista (ICC, FIOCRUZ - CARLOS CHAGAS INSTITUTE, FIOCRUZ); Paulo Costa Carvalho (ICC, FIOCRUZ - CARLOS CHAGAS INSTITUTE, FIOCRUZ);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: PROTEOMIC, BIOINFORMATIC, BIOTECHNOLOGY, PROTEIN SEQUENCING,
Uncovering novel biosynthetic gene clusters and chemical diversity in marine cyanobacterium Capilliphycus salinus ALCB114379 through metabologenomics
Gabriel Schimmelpfeng Passos (CENA/USP - Center for Nuclear Energy in Agriculture at the University of São Paulo); Fernanda Rios Jacinavicius (CENA/USP - Center for Nuclear Energy in Agriculture at the University of São Paulo); Tiago Ferreira Leão (Unesp - São Paulo State University); Ian Castro-Gamboa (Unesp - São Paulo State University); Marli de Fátima Fiore (CENA/USP - Center for Nuclear Energy in Agriculture at the University of São Paulo);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: AntiSMASH, BigSCAPE, GNPS, Secondary Metabolite,
Prospecting Antimicrobial Peptides from Medicinal Plants Using Bioinformatics Tools
Priscila Barbosa de Souza (UEMG - Universidade do Estado de Minas Gerais); Letícia Ferreira Figueiredo Moreira Vieira (UEMG - Universidade do Estado de Minas Gerais); Jonas Rodrigues dos Santos (UEMG - Universidade do Estado de Minas Gerais); Swiany Silveira Lima (UEMG - Universidade do Estado de Minas Gerais); Patrícia Dias Games (UEMG - Universidade do Estado de Minas Gerais);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Antimicrobial peptides, Bioinformatics, Medicinal plants, ,
OmicScope unravels systems-level insights from quantitative proteomics data
Guilherme Reis-de-Oliveira (CPB - Boldrini Research Center); Victor Corasolla Carregari (LNP - Laboratory of Neuroproteomics); Daniel Martins-de-Souza (LNP - Laboratory of Neuroproteomics);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Differential proteomics, Enrichment, Protein-protein interaction, Systems Biology,
Differentially Expressed Proteins in the Prefrontal Cortex of Individuals with Alcohol Use Disorder: a Multi-level Biological Network Analysis
Laura Piloneto Lima Hoefel (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul); Rianne Remus Pulcinelli (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul); Felipe Borges Almeida (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul); Giovana Mezzomo (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul); Adriane Ribeiro Rosa (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul); Rosane Gomez (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Ethanol, Proteomics, Post-mortem brain, Humans,
Proteomic and Transcriptomic Insights into Noise-Induced Hearing Loss
Ana Carolina Ferreira Scatone (LIM32 - Laboratório de Investigação Médica de Otorrinolaringologia); Danillo Alencar Coutinho (LIM32 - Laboratório de Investigação Médica de Otorrinolaringologia); Jeanne Oiticica (LIM32 - Laboratório de Investigação Médica de Otorrinolaringologia); Ricardo Ferreira Bento (LIM32 - Laboratório de Investigação Médica de Otorrinolaringologia); Karina Lezirovitz (LIM32 - Laboratório de Investigação Médica de Otorrinolaringologia); Ana Carla Batissoco (LIM32 - Laboratório de Investigação Médica de Otorrinolaringologia);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Proteomics, Transcriptomics, Noise-induced hearing loss, Cochlea,
Rapid mass spectrometry-based sequencing of an anti-SARS-CoV-2 spike S2 antibody using multiple proteases
Jackelinne Yuka Hayashi (UNIFESP - Federal University of São Paulo); Alison Felipe Alencar Chaves (CeTICS - Laboratory of Applied Toxinology, Center of Toxins, Immune-Response and Cell Signaling); Daniela Luz Hessel da Cunha (IBu - Laboratory of Bacteriology); Isaías Glezer (UNIFESP - Federal University of São Paulo); Solange Maria de Toledo Serrano (CeTICS - Laboratory of Applied Toxinology, Center of Toxins, Immune-Response and Cell Signaling); Alexandre Keiji Tashima (UNIFESP - Federal University of São Paulo);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Antibody, mass spectrometry, de novo sequencing, SARS-CoV-2,
IDENTIFICATION OF REGULATORY CIRCUITS THROUGH NETWORK ANALYSIS: HSA-MIR-200B AND CFL2 AS IMPORTANT COMPONENT IN INSTESTINAL GASTRIC CANCER PATHOGENESIS
Everton Cruz dos Santos (DiLabEsp - INCA - Divisão de Laboratórios Especializados do Instituto Nacional de Câncer); Paulo Henrique Nascimento Rohan (DiLabEsp - INCA - Divisão de Laboratórios Especializados do Instituto Nacional de Câncer); Renata Binato (DiLabEsp - INCA - Divisão de Laboratórios Especializados do Instituto Nacional de Câncer); Eliana Abdelhay (DiLabEsp - INCA - Divisão de Laboratórios Especializados do Instituto Nacional de Câncer);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Intestinal gastric cancer, proteomics, miRNomics, transcriptomics,
Evolutionary relationships of Trypanosomes in the subfamily Leishmaniinae from a quantitative proteomics point of view: The PhyloQuant approach
Mule (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); Alemán (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); Fernandes (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); Saad (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); de Oliveira (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); Martins (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); Angeli (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); Brandt-Almeida (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); Cortez (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); Larsen (SDU - Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Southern Denmark, Odense, DK, Denmark); Shaw (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); Teixeira (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil); Palmisano (USP - Parasitology Department - Institute of Biomedical Science II - University of Sao Paulo, Sao Paulo – Brazil);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: PhyloQuant, Evolution, Mass spectrometry, Proteomics,
Microwave-assisted digestion of monoclonal antibodies
Thais Mingatos de Toledo (USP - University of São Paulo); Antônio Moreira Marques Neto (USP - University of São Paulo); Simon Ngao Mule (USP - University of São Paulo); Priscila Robertina dos Santos-Donado (USP - University of São Paulo); Claudia Blanes Angeli (USP - University of São Paulo); Giuseppe Palmisano (USP - University of São Paulo);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Microwave-assisted digestion, post-translational modifications, glycosylation, monoclonal antibodies,
Oxonium ions-dependent mass spectrometry method to measure the glycosylation features of glycoproteins
Claudia Blanes Angeli (ICB-USP - Glycoproteomics Laboratory - Institute of Biomedical Sciences - Department of Parasitology - University of Sao Paulo); Lucas Cardoso Lázari (ICB-USP - Glycoproteomics Laboratory - Institute of Biomedical Sciences - Department of Parasitology - University of Sao Paulo); Thais Mingatos de Toledo (ICB-USP - Glycoproteomics Laboratory - Institute of Biomedical Sciences - Department of Parasitology - University of Sao Paulo); Antônio Moreira Marques Neto (ICB-USP - Glycoproteomics Laboratory - Institute of Biomedical Sciences - Department of Parasitology - University of Sao Paulo); Lívia Rosa Fernandes (MQ - Centre for Motor Neuron Disease Research, Faculty of Medicine Health and Human Sciences, Macquarie Medical School); Giuseppe Palmisano (ICB-USP - Glycoproteomics Laboratory - Institute of Biomedical Sciences - Department of Parasitology - University of Sao Paulo);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: protein glycosylation, oxonium ions, LC-MS/MS, protein therapeutics,
Mass spectrometry sequencing of a SARS-CoV-2 anti-spike S1 monoclonal antibody
Isabel Sakanoue Leite (UNIFESP - Federal University of Sao Paulo); Jackelinne Yuka Hayashi (UNIFESP - Federal University of Sao Paulo); Alexandre Keiji Tashima (UNIFESP - Federal University of Sao Paulo);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: monoclonal antibody, mass spectrometry, proteomics, SARS-CoV-2,
Multi-level biological network analysis of differentially expressed proteins in the corpus callosum of chronic alcohol users
Felipe Borges Almeida (UFRGS - Programa de Pós-Graduação em Farmacologia e Terapêutica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul); Laura Piloneto Lima Hoefel (UFRGS - Programa de Pós-Graduação em Farmacologia e Terapêutica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul); Rianne Remus Pulcinelli (UFRGS - Programa de Pós-Graduação em Farmacologia e Terapêutica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul); Giovana Mezzomo (UFRGS - Programa de Pós-Graduação em Farmacologia e Terapêutica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul); Adriane Ribeiro Rosa (UFRGS - Programa de Pós-Graduação em Farmacologia e Terapêutica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul); Rosane Gomez (UFRGS - Programa de Pós-Graduação em Farmacologia e Terapêutica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: ethanol, alcohol use disorder, proteomics, humans,
Integrated bottom-up and top-down analysis reveals new proteoforms in the venom of an individual Bothrops pauloensis specimen
Claudia de Paula Santos (UNIFESP - Federal University of São Paulo); Alexandre Keiji Tashima (UNIFESP - Federal University of São Paulo); Jackelinne Yuka Hayashi (UNIFESP - Federal University of São Paulo); Anita Mitico Tanaka-Azevedo (IBu - Laboratory of Herpetology); Lídia Jorge Tasima (IBu - Laboratory of Herpetology);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Bothrops pauloensis, bottom-up, top-down, de novo sequencing ,
Navigating Blindly Through a Proteomics Dataset: Sponge Proteomics Study
Carolaine da Silva de Araújo (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro); Fábio César Sousa Nogueira (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro); Alessandra Leda Valverde (UFF - Universidade Federal Fluminense); Magno Rodrigues Junqueira (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Marine Sponge, Metaproteomics, De novo sequencing, ,
GlycoP: a software for intact glycopeptide identification and quantification using mass spectrometry-based methods
Lucas Cardoso Lázari (USP - Universidade de São Paulo); Claudia Blanes Angeli (USP - Universidade de São Paulo); Giuseppe Palmisano (USP - Universidade de São Paulo);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Protein Identification, Glycoproteomics, Software, Search Engine,
Isobaric Labeling Optimization for Limited Samples and Large Experimental Designs
Michele Rodrigues Martins (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro); Guillaume Nugue (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro); Fábio César Sousa Nogueira (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro); Magno Rodrigues Junqueira (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Isobaric Labeling, Quantitative Proteomics, Multiplexing, Tandem Mass Tags (TMT),
Identification of cell surface proteins susceptible to oxidation during the cell adhesion process in endothelial cells using a proteomic redox
Danielle Fernandes Vileigas (IQ-USP - Department of Biochemistry, Institute of Chemistry, University of São Paulo); Beatriz Pereira da Silva (IQ-USP - Department of Biochemistry, Institute of Chemistry, University of São Paulo); Railmara Pereira da Silva (IQ-USP - Department of Biochemistry, Institute of Chemistry, University of São Paulo); Mariana Pereira Massafera (IQ-USP - Department of Biochemistry, Institute of Chemistry, University of São Paulo); Flavia Carla Meotti (IQ-USP - Department of Biochemistry, Institute of Chemistry, University of São Paulo);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: cell adhesion, oxidation, extracellular thiol proteins, proteomic,
Development of a genetic tool to map protein-protein interactions associated with neurological disorders
Victor Henrique Spada Santos (USP - IQ - Universidade de São Paulo - Instituto de Química); Danilo Bilches Medinas (USP - IQ - Universidade de São Paulo - Instituto de Química);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Interações proteína-proteína, PDI, Deficiência intelectual, Interatômica,
Optimization of strategies for proteomic data analysis from the velvetbean caterpillar Anticarsia gemmatalis as a non-canonical organism model
Pedro Henrique Bastos de Oliveira Nascimento (IFRJ - Instituto Federal do Rio de Janeiro); Michele Rodrigues Martins (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro); Luís Felipe Costa Ramos (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro); Fábio César Sousa Nogueira (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro); Danielle Maria Perpétua de Oliveira (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro); Magno Rodrigues Junqueira (UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: De novo sequencing, Proteomics, A. gemmatalis, Mass spectrometry,
Development of Analytical Methods for Identifying and Quantifying Oxidized Phospholipids in Ferroptosis
Tarik Daniel de Santana Kissuani (IQ - USP - Chemistry Institute, University of São Paulo); Sayuri Miyamoto (IQ - USP - Chemistry Institute, University of São Paulo); Larissa Diniz (IQ - USP - Chemistry Institute, University of São Paulo); Thais Satie Iijima (IQ - USP - Chemistry Institute, University of São Paulo);
Área: Metodologias inovadoras e ferramentas computacionais nas ciências ômicas Palavras-chave: Lipidomics, Oxidized lipids, , ,